Thị trấn Yên Thịnh cách trung tâm thành phố Ninh Bình 14 km, có vị trí địa lý:

• Phía đông giáp các xã Khánh Thịnh, Yên Phong
• Phía tây giáp các xã Khánh Thượng, Yên Hòa
• Phía nam giáp xã Yên Hưng
• Phía bắc giáp các xã Khánh Thịnh, Khánh Dương.

Thị trấn Yên Thịnh hiện có 2 đường quốc lộ 12B và 21B đi qua, là điểm nối giữa 2 trung tâm Tam Điệp và Phát Diệm của Ninh Bình. Ở phố Trung Yên của thị trấn có chợ Ngò.